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Les salariés sont souvent des habitués de l'IM. Il n'est donc pas rare qu'ils l'installent en entreprise, lorsqu'ils disposent des droits sur leur poste de travail. Cependant, les IM grand public présentent des risques d'infection par des programmes malveillants. Leur usage est par conséquent souvent prohibé ou directement bloqué sur le poste de travail ou le réseau. Néanmoins, l'IM s'impose progressivement comme un outil collaboratif en entreprise. Afin de restreindre les risques d'infection, les IM professionnelles pourront être privilégiées. Des applications basées sur le standard Jabber apporteront en outre l'interopérabilité, contrairement à des solutions construites sur des protocoles propriétaires.
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